ＲＮＡーＳｅｑデータ解析 ＷＥＴラボのための超鉄板レシピ ヒトから非モデル生物まで公共データの活用も充実 改訂版 /坊農秀雅

≪商品情報≫

著者名：坊農秀雅
出版社名：羊土社
発行年月：2023年10月
判型：Ａ４変
ISBN：9784758122672


≪内容情報≫

"RNA-Seqデータの解析法が""料理レシピのように""step-by-stepでわかる好評書の改訂第2版です．
Apple silicon搭載MacやWindows＋Docker環境を前提にしたほか，リファレンスゲノムを用いない解析やメタ解析をさらに充実．

「サンプルXにはどんな種類の細胞が含まれる？」
「サンプルYとサンプルZの違いを規定する遺伝子はなに？」
といった医学・生命科学研究でよく出会うquestionにこれからRNA-Seqでアプローチする方にも，解析法をアップデートしたい方にも，三ツ星おすすめの""超""鉄板レシピが満載です．

著者から更新情報が届く「Annual Updateサービス（※）」も付録しています．
※ 出版1年後を初回として，以降1年ごとに1回，計3回（3年間）の更新を予定

Chapter 1 まずはこれだけ！ 解析環境を整える
Chapter 2 データを入手する
Chapter 3 転写産物の発現を定量する
Chapter 4 リファレンスゲノムのない生物でde novo解析を行う
Chapter 5 発現変動遺伝子群を検出する
Chapter 6 サンプル間で発現変動した遺伝子群の機能を推定する
Chapter 7 サンプル間の類似度を比較する
Chapter 8 公共データから興味あるデータを抽出，発現変動遺伝子群を検出する（メタ解析）
Chapter 9 リードカウント以降の統合解析をウェブブラウザで行う
Chapter 10 論文投稿に必須！データを登録・公開する"