RNA-Seqデータ解析 WETラボのための超鉄板レシピ ヒトから非モデル生物まで公共データの活用も充実/坊農秀雅

坊農秀雅
羊土社
ISBN：4758122679/9784758122672
発売日:2023年10月

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【内容紹介】
RNA－Seqデータの解析法が"料理レシピのように"step－by－stepでわかる好評書の改訂第2版です.
Apple silicon搭載MacやWindows+Docker環境を前提にしたほか、リファレンスゲノムを用いない解析やメタ解析をさらに充実.

「サンプルXにはどんな種類の細胞が含まれる?」
「サンプルYとサンプルZの違いを規定する遺伝子はなに?」
といった医学・生命科学研究でよく出会うquestionにこれからRNA－Seqでアプローチする方にも、解析法をアップデートしたい方にも、三ツ星おすすめの"超"鉄板レシピが満載です.

著者から更新情報が届く「Annual Updateサービス(※)」も付録しています.
※ 出版1年後を初回として、以降1年ごとに1回、計3回(3年間)の更新を予定

Chapter 1 まずはこれだけ! 解析環境を整える
Chapter 2 データを入手する
Chapter 3 転写産物の発現を定量する
Chapter 4 リファレンスゲノムのない生物でde novo解析を行う
Chapter 5 発現変動遺伝子群を検出する
Chapter 6 サンプル間で発現変動した遺伝子群の機能を推定する
Chapter 7 サンプル間の類似度を比較する
Chapter 8 公共データから興味あるデータを抽出、発現変動遺伝子群を検出する(メタ解析)
Chapter 9 リードカウント以降の統合解析をウェブブラウザで行う
Chapter 10 論文投稿に必須!データを登録・公開する